Синдром раздражённого кишечника (СРК) остаётся одним из наиболее распространённых функциональных гастроинтестинальных расстройств, патогенез которого многогранен и недостаточно изучен. В последнее десятилетие накоплены убедительные данные о ключевой роли дисбиоза кишечной микробиоты в развитии и персистенции симптомов СРК.
Современные высокоточные методы, такие как генетическое секвенирование (секвенирование гена 16S рРНК и полногеномное метагеномное секвенирование), позволяют детально охарактеризовать таксономический и функциональный состав микробного сообщества. Это открывает путь к персонализированному подходу в диагностике и лечении СРК, основанному на коррекции выявленных нарушений микробиоты.
В данном обзоре обобщены современные представления о роли микробиоты в патогенезе СРК, рассмотрены возможности и преимущества генетического секвенирования для оценки дисбиоза и обсуждаются перспективы таргетной терапии.
Дисбиоз напрямую влияет на развитие симптомов СРК / Источник: Unsplash
Станьте частью сообщества
Распространённость СРК в мире достигает 10–15%, что обуславливает значительное медико-социальное и экономическое бремя заболевания. Согласно Римским критериям IV пересмотра, СРК характеризуется рецидивирующей абдоминальной болью, связанной с дефекацией и изменением частоты или формы стула. Несмотря на многообразие терапевтических подходов, их эффективность часто ограничена, что связано с недостаточным пониманием патогенетических механизмов.
Современная парадигма рассматривает СРК как расстройство взаимодействия по оси кишечник — мозг, в котором кишечная микробиота играет центральную роль. Дисбиоз — качественное и количественное нарушение состава микробиоты — признан одним из ключевых триггеров, влияющих на моторику, висцеральную чувствительность, кишечный барьер и иммунный ответ.
Роль микробиоты в патогенезе СРК: от дисбиоза к симптомам
Кишечная микробиота, насчитывающая триллионы микроорганизмов, находится в сложном симбиозе с хозяином. Её дисбаланс при СРК проявляется в нескольких взаимосвязанных направлениях:
Нарушение колонизационной резистентности и метаболизма
Для СРК характерно снижение общего видового разнообразия (alpha-diversity), что является маркером нестабильности экосистемы. Часто наблюдается уменьшение численности противовоспалительных бактерий, таких как Faecalibacterium prausnitzii (продуцент бутирата), и увеличение условно-патогенных представителей (протеобактерии, Ruminococcus gnavus). Это нарушает продукцию короткоцепочечных жирных кислот (КЖК), что негативно сказывается на целостности эпителиального барьера и энергообеспечении колоноцитов.
Влияние на висцеральную чувствительность и моторику
Микробные метаболиты (КЖК, желчные кислоты, газы) способны напрямую воздействовать на энтероэндокринные клетки, афферентные нервные окончания и гладкую мускулатуру, модулируя моторику и болевую чувствительность. Дисбиоз может провоцировать избыточное газообразование и растяжение стенки кишки, усиливая абдоминальный дискомфорт.
Иммунная активация и «метаболическая эндотоксемия»
Повреждение кишечного барьера на фоне дисбиоза (снижение экспрессии белков плотных контактов) способствует транслокации бактериальных липополисахаридов (ЛПС) в системный кровоток. Это запускает каскад иммунных реакций с активацией тучных клеток и выделением провоспалительных цитокинов, что поддерживает нейровоспаление и висцеральную гиперчувствительность.
Модуляция оси кишечник — мозг
Микробиота продуцирует нейроактивные вещества (серотонин, ГАМК, дофамин), влияющие на настроение и поведение. Это частично объясняет высокую коморбидность СРК с тревожными и депрессивными расстройствами.
Стресс усиливает симптомы ЖКТ, а постоянный дискомфорт провоцирует тревогу / Источник: Freepik
Генетическое секвенирование как золотой стандарт оценки микробиоты
Традиционные микробиологические методы (посев) не отражают полного разнообразия микробиоты, так как большинство бактерий не культивируется. Генетическое секвенирование решает эту проблему, обеспечивая высокодетальную и объективную характеристику микробного сообщества. Выделяют два основных подхода:
Секвенирование гена 16S рРНК
Этот метод основан на амплификации и анализе консервативного бактериального гена 16S рибосомной РНК. Он позволяет идентифицировать таксоны до уровня рода (реже — вида) и оценить относительную численность различных групп бактерий. Его преимущества: относительно низкая стоимость и высокая пропускная способность, что делает его идеальным для скрининговых исследований и оценки альфа- и бета-разнообразия.
Полногеномное метагеномное секвенирование (Shotgun Metagenomics)
Этот метод предполагает секвенирование всех генетических последовательностей в образце. Он предоставляет более глубокую информацию, включая идентификацию до уровня вида и штамма, а также позволяет оценить функциональный потенциал микробиоты (наличие генов, связанных с синтезом витаминов, КЖК, устойчивостью к антибиотикам).
Секвенирование 16S рРНК — золотой стандарт оценки микробиоты / Источник: Freepik
Применение данных секвенирования в персонализированном ведении пациента с СРК
Результаты генетического анализа микробиоты переводят лечение СРК на новый персонализированный уровень.
Диагностика и стратификация. Выявление специфического «микробного профиля» может помочь в подтипировании СРК (с преобладанием запора, диареи или смешанного типа) и дифференциальной диагностике с другими заболеваниями (например, воспалительными заболеваниями кишечника).
Целевой подбор пробиотиков и пребиотиков. Вместо эмпирического назначения стандартных пробиотических комплексов терапия может быть направлена на коррекцию конкретного дефицита. Например, при снижении количества лактобацилл или бифидобактерий назначаются штаммы, направленные на их восполнение. Пребиотики (инулин, олигофруктоза) подбираются с учётом способности микробиоты пациента их ферментировать.
Оптимизация диетотерапии. Диета с низким содержанием FODMAP-углеводов может быть адаптирована на основе данных о ферментативном потенциале микробиоты, что позволяет минимизировать её ограничительный характер и повысить эффективность.
Контроль эффективности терапии. Повторное секвенирование после курса лечения (пробиотиками, антибиотиками, диетой) позволяет объективно оценить изменения в составе микробиоты и скорректировать тактику.
Перспективы исследования микробиоты в лечении СРК
Интеграция генетического секвенирования микробиоты в клиническую практику открывает новые горизонты в понимании и лечении СРК. Подход, основанный на коррекции выявленного с помощью современных молекулярных методов дисбиоза, является патогенетически обоснованным и персонализированным.
Дальнейшие исследования должны быть сфокусированы на стандартизации методов анализа, установлении чётких причинно-следственных связей между конкретными таксонами и симптомами СРК, а также на проведении крупных рандомизированных клинических исследований, доказывающих эффективность и экономическую целесообразность такого подхода в долгосрочной перспективе.
Развитие микробиомных исследований и их внедрение в клиническую практику требуют не только качественных диагностических инструментов, но и глубокой подготовки специалистов. Именно для этого была создана Академия Novabiom — образовательная платформа для врачей и специалистов, работающих с микробиотой кишечника.
Обучение в Академии Novabiom включает теоретическую базу об основах функционирования микробиоты кишечника и её роли в развитии заболеваний, практический курс по работе с результатами исследований и применению вычислительной диеты, а также эксклюзивные лекции, вебинары, клинические кейсы и обзоры научных исследований от ведущих экспертов в области микробиоты.
Научные источники
- Ford, A. C., Sperber, A. D., Corsetti, M., & Camilleri, M. (2020). Irritable bowel syndrome. The Lancet, 396(10263), 1675-1688.
- Mars, R. A. T., et al. (2023). Longitudinal multi-omics reveals subset-specific mechanisms underlying irritable bowel syndrome. Nature Microbiology, 8(5), 987-1000.
- Simren, M., et al. (2021). Intestinal microbiota in functional bowel disorders: a Rome foundation report. Gut, 70(8), 1581-1592.
- Vich Vila, A., et al. (2020). Gut microbiota composition and functional changes in irritable bowel syndrome and inflammatory bowel disease. Gastroenterology, 158(6), 1580-1592.
- Gilbert, J. A., et al. (2018). Current understanding of the human microbiome. Nature Medicine, 24(4), 392-400.
